Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FAM208BQ5VWN6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FAM208BQ5VWN6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FAM208BQ5VWN6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FAM208BQ5VWN6 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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FAM208BQ5VWN6 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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FAM208BQ5VWN6 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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FAM208BQ5VWN6 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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FAM208BQ5VWN6 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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