Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms