Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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RTL8BQ17RB0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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RTL8BQ17RB0 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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RTL8BQ17RB0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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RTL8BQ17RB0 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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