Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
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