Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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