Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FXNQ16595 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FXNQ16595 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FXNQ16595 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FXNQ16595 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FXNQ16595 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FXNQ16595 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FXNQ16595 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FXNQ16595 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FXNQ16595 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FXNQ16595 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FXNQ16595 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FXNQ16595 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FXNQ16595 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FXNQ16595 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FXNQ16595 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FXNQ16595 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FXNQ16595 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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FXNQ16595 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FXNQ16595 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FXNQ16595 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FXNQ16595 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FXNQ16595 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FXNQ16595 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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FXNQ16595 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FXNQ16595 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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FXNQ16595 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FXNQ16595 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FXNQ16595 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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FXNQ16595 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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FXNQ16595 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FXNQ16595 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FXNQ16595 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FXNQ16595 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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FXNQ16595 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FXNQ16595 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FXNQ16595 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FXNQ16595 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FXNQ16595 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FXNQ16595 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FXNQ16595 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FXNQ16595 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FXNQ16595 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FXNQ16595 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FXNQ16595 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FXNQ16595 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FXNQ16595 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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