Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SSX1Q16384 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SSX1Q16384 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SSX1Q16384 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SSX1Q16384 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SSX1Q16384 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SSX1Q16384 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SSX1Q16384 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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