Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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