Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCN9AQ15858 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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