Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
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ALX1Q15699 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
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ALX1Q15699 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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ALX1Q15699 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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