Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHBQ15464 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHBQ15464 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHBQ15464 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHBQ15464 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHBQ15464 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHBQ15464 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHBQ15464 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHBQ15464 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHBQ15464 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHBQ15464 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHBQ15464 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHBQ15464 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHBQ15464 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHBQ15464 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHBQ15464 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHBQ15464 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHBQ15464 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SHBQ15464 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHBQ15464 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHBQ15464 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHBQ15464 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHBQ15464 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHBQ15464 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHBQ15464 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHBQ15464 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHBQ15464 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHBQ15464 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHBQ15464 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHBQ15464 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHBQ15464 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms