Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms