Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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