Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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