Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms