Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.5 ms