Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms