Protein–RNA interactions for Protein: Q13636

RAB31, Ras-related protein Rab-31, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB31Q13636 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB31Q13636 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB31Q13636 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB31Q13636 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB31Q13636 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB31Q13636 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB31Q13636 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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RAB31Q13636 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB31Q13636 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB31Q13636 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB31Q13636 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB31Q13636 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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RAB31Q13636 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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RAB31Q13636 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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RAB31Q13636 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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RAB31Q13636 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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RAB31Q13636 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB31Q13636 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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