Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms