Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 QARS-206ENST00000452739 1044 ntTSL 512.96□□□□□ -0.337e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 QARS-213ENST00000470619 876 ntTSL 412.94□□□□□ -0.347e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 QARS-238ENST00000635231 578 ntTSL 412.86□□□□□ -0.357e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 QARS-236ENST00000635052 570 ntTSL 512.85□□□□□ -0.357e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 QARS-234ENST00000634802 599 ntTSL 412.85□□□□□ -0.357e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 QARS-230ENST00000634527 732 ntTSL 512.79□□□□□ -0.367e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 QARS-203ENST00000417025 572 ntTSL 512.58□□□□□ -0.47e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 QARS-215ENST00000479495 577 ntTSL 411.28□□□□□ -0.67e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 QARS-226ENST00000634359 437 ntTSL 510.85□□□□□ -0.677e-6■■□□□ 12.3
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PABPC4Q13310 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.617e-8■■□□□ 12.3
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PABPC4Q13310 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.511e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 ACAT2-203ENST00000472052 1641 ntTSL 211.49□□□□□ -0.571e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 SAFB2-203ENST00000587802 583 ntTSL 326.86■■□□□ 1.891e-7■■□□□ 12.3
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PABPC4Q13310 CEP85-206ENST00000476272 3507 ntTSL 29.76□□□□□ -0.855e-7■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.115e-7■■□□□ 12.3
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PABPC4Q13310 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.649e-7■■□□□ 12.3
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PABPC4Q13310 AC006030.1-201ENST00000451608 5059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.521e-30■■□□□ 12.3
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PABPC4Q13310 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.529e-15■■□□□ 12.3
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PABPC4Q13310 MAPK8-201ENST00000360332 5438 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.882e-7■■□□□ 12.2
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PABPC4Q13310 SLC25A17-210ENST00000435456 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.421e-7■■□□□ 12.2
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PABPC4Q13310 SLC25A17-216ENST00000491545 2530 ntTSL 1 (best)9.96□□□□□ -0.811e-7■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.661e-7■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 CTC1-201ENST00000315684 7021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.771e-38■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 LARP4B-212ENST00000614908 1826 ntTSL 422.88■■□□□ 1.259e-7■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.459e-7■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 LARP4B-201ENST00000316157 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.319e-7■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 THAP7-203ENST00000466670 1080 ntTSL 522.87■■□□□ 1.252e-7■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.992e-7■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 POLE4-202ENST00000459636 760 ntTSL 323.09■■□□□ 1.292e-7■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.272e-7■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 POLE4-206ENST00000485527 405 ntTSL 222.98■■□□□ 1.272e-7■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 ILK-207ENST00000526711 1594 ntTSL 219.51■□□□□ 0.712e-7■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.182e-7■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 ILK-215ENST00000537806 1801 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.312e-7■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 ILK-210ENST00000528995 1559 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.42e-7■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 ILK-202ENST00000396751 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.492e-7■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 ILK-206ENST00000526318 596 ntTSL 311.93□□□□□ -0.52e-7■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.788e-7■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 C14orf2-210ENST00000555030 749 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.432e-7■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 C14orf2-202ENST00000414262 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.762e-7■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 C14orf2-201ENST00000286953 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.782e-7■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 C14orf2-209ENST00000554880 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.022e-7■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.262e-6■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.22e-6■■□□□ 12.2
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