Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCP2Q13094 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms