Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXF2Q12947 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms