Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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