Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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