Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms