Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms