Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms