Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms