Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms