Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms