Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms