Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms