Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms