Protein–RNA interactions for Protein: P62633

CNBP, Cellular nucleic acid-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBPP62633 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CNBPP62633 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CNBPP62633 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CNBPP62633 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CNBPP62633 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CNBPP62633 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CNBPP62633 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CNBPP62633 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CNBPP62633 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CNBPP62633 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CNBPP62633 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CNBPP62633 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CNBPP62633 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CNBPP62633 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CNBPP62633 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CNBPP62633 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CNBPP62633 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CNBPP62633 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CNBPP62633 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CNBPP62633 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CNBPP62633 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CNBPP62633 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CNBPP62633 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CNBPP62633 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CNBPP62633 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CNBPP62633 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CNBPP62633 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CNBPP62633 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CNBPP62633 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CNBPP62633 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CNBPP62633 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CNBPP62633 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CNBPP62633 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CNBPP62633 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CNBPP62633 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNBPP62633 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNBPP62633 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNBPP62633 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNBPP62633 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNBPP62633 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNBPP62633 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNBPP62633 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNBPP62633 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNBPP62633 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNBPP62633 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNBPP62633 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNBPP62633 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNBPP62633 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNBPP62633 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms