Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms