Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB28P51157 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB28P51157 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms