Protein–RNA interactions for Protein: P51151

RAB9A, Ras-related protein Rab-9A, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9AP51151 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms