Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTBP49356 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms