Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK1DP48730 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms