Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NESP48681 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NESP48681 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NESP48681 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NESP48681 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NESP48681 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NESP48681 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NESP48681 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NESP48681 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NESP48681 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NESP48681 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NESP48681 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NESP48681 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NESP48681 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NESP48681 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NESP48681 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NESP48681 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NESP48681 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NESP48681 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NESP48681 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NESP48681 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NESP48681 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NESP48681 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NESP48681 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NESP48681 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NESP48681 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NESP48681 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NESP48681 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NESP48681 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NESP48681 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NESP48681 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NESP48681 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NESP48681 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NESP48681 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
NESP48681 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
NESP48681 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NESP48681 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NESP48681 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NESP48681 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NESP48681 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NESP48681 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NESP48681 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NESP48681 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NESP48681 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NESP48681 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NESP48681 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NESP48681 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NESP48681 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NESP48681 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NESP48681 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NESP48681 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NESP48681 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NESP48681 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NESP48681 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NESP48681 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NESP48681 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NESP48681 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NESP48681 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NESP48681 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NESP48681 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NESP48681 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NESP48681 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NESP48681 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NESP48681 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NESP48681 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NESP48681 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NESP48681 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NESP48681 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NESP48681 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NESP48681 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NESP48681 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NESP48681 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NESP48681 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NESP48681 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NESP48681 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NESP48681 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NESP48681 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NESP48681 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NESP48681 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NESP48681 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NESP48681 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NESP48681 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NESP48681 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NESP48681 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NESP48681 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NESP48681 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NESP48681 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NESP48681 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NESP48681 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NESP48681 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NESP48681 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NESP48681 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NESP48681 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NESP48681 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NESP48681 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NESP48681 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms