Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms