Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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