Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP1P29466 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP1P29466 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP1P29466 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP1P29466 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP1P29466 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP1P29466 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP1P29466 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP1P29466 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP1P29466 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP1P29466 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP1P29466 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP1P29466 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP1P29466 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP1P29466 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP1P29466 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP1P29466 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP1P29466 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP1P29466 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP1P29466 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP1P29466 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP1P29466 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP1P29466 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP1P29466 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP1P29466 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CASP1P29466 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CASP1P29466 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CASP1P29466 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CASP1P29466 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CASP1P29466 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CASP1P29466 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CASP1P29466 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP1P29466 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP1P29466 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP1P29466 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP1P29466 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP1P29466 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP1P29466 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP1P29466 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP1P29466 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP1P29466 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP1P29466 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP1P29466 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP1P29466 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP1P29466 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP1P29466 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP1P29466 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms