Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms