Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
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