Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms