Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB2P26583 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms