Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms