Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A1P19634 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms