Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms